Lors de cet atelier, Pierre Barbillon et Emré Anakok nous ont présenté les réseaux de neurones graphiques puis leur implémentation avec pytorch geometric.
Aide à l’installation Pour l’installation de Python et la création d’environnement pour ceux qui n’ont pas l’habitude de Python
Hugo Gangloff nous a concocté une séance sur l’utilisation des auto-encodeurs variationnels pour le traitement de données single-cell RNA-Seq en Python avec PyTorch.
Résumé :
Cet atelier Happy R est divisé en trois parties dédiées aux autoencodeurs variationnels (VAE) (Kingma and Welling 2014) pour le traitement de données scRNA-seq.
Charles Ollion et Sylvain Le Corff (CMAP) nous ont proposé une session pratique autour de l’apprentissage profond bayésien.
Summary
Deep learning is widely used for regression and classification problems, but the simplest architectures do not capture model uncertainty.