Au programme de ce premier atelier de la saison 2022-2023 une présentation du réseau et un retour sur le camp d’été 2022 à la station biologique de Paimpont :
Présentation du réseau et des sujets abordés lors du bootcamp 2022 Comment fouiller dans les bases de données de R et sur github pour lister les packages développés par le labo ?
Pour ce premier atelier sur notre nouveau campus de Palaiseau, Nicolas Jouvin (UMR MIA-Paris-Saclay) nous a présenté son package {greed}, développé avec E. Côme (IFSTTAR).
{greed} Clustering and Model Selection with the Integrated Classification Likelihood
Cédric Midoux nous a présenté une démonstration de construction d’une application shiny avec le package golem.
Lien vers le dépôt d’une application exemple.
Le 14 janvier nous nous sommes retrouvés pour une séance premiers pas pour débuter avec le package {shiny} permettant le développement d’application web interactive avec R. L’objectif étant de s’autoformer à partir de supports existants et d’échanges pour nous permettre de suivre sereinement la séance de février (par C.
Sophie Donnet and Julie Aubert propose us an introductory workshop on variational autoencoders using the keras R package under RStudio.
The slides are downloadable here and the tutorial here for the complete html version and here for the only R command.
Eric Adjakossa et Tâm Le Minh ont animé un atelier pratique de découverte de git :
Apprendre à utiliser Git pour profiter des nombreux avantages qu’il offre, y compris l’organisation efficace d’un travail collaboratif.
Charles Ollion et Sylvain Le Corff (CMAP) nous ont proposé une session pratique autour de l’apprentissage profond bayésien.
Summary
Deep learning is widely used for regression and classification problems, but the simplest architectures do not capture model uncertainty.
Ghislain Durif a animé un premier atelier pratique autour des problèmes de l’optimisation et de leur résolution (résumé ci-dessous) le 12 février 2020.
Les instructions pour installer les différents packages pour les tutoriels sont disponibles ici.
Ghislain Durif a animé un premier atelier pratique autour des problèmes de l’optimisation et de leur résolution (résumé ci-dessous) le 22 janvier.
Les instructions pour installer les différents packages pour les tutoriels sont disponibles [ici] (https://github.
Source principale : (https://rmarkdown.rstudio.com/authoring_bibliographies_and_citations.html)
Lister ses références A l’aide d’un fichier de bibliographie Pandoc peut générer automatiquement des citations et une bibliographie dans différents styles. Il suffit de préciser le nom du fichier de bibligraphie en utilisant le champs bibliography dans le YAML des métadonnées du document .