workshop

Développement autour du R-Markdown

Le programme de l’atelier proposé sur des développements autour de R Markdown Créer des contenus pour R Markdown et shiny – Reporting tabulaire avec le package flextable Les fonctionnalités du package Les techniques utilisées pour l’intégration avec knitr Pratiquons : Créer une méthode d’impression tabulaire avec knitr et flextable pour les documents R Markdown – htmlwidgets : package ggiraph Les fonctionnalités du package Intégration dans le contexte shiny et dans le contexte R Markdown Implémentation du htmlwidget Pratiquons : Créer un simple htmlwidget Personnalisation des documents R Markdown Le triptyque CSS/JavaScript/HTML Exemples de thèmes xaringan, pagedown, blogdown Pratiquons : personnalisation d’un thème pagedown et d’un thème xaringan (https://github.

R-Mxnet pour des applications du deep learning

Christophe Botella nous a preparé un atelier pratique présentant le deep learning et comment le mettre en application avec le package {R-Mxnet}. Le code de l’atelier Et la présentation

Comment Shiny peut vous aider dans vos simulations, vos collaborations et vos cours

Pierre et Benjamin nous ont préparé ‘quelque chose sur Shiny’: La présentation

Introduction à plotly

Au cours d’une séance découverte un peu spécial, donnée lors de l’assemblée générale du département de mathématique et informatique de l’INRA, Mahendra nous a fait découvrir les potentialités de {plotly,ggplotly,crosscall}

rSTAN, un outil d'inférence bayésienne

Matthieu et Éric nous propose une séance sur {rSTAN}, l’interface R à la bibliothèque C++ Stan. Il s’agit d’algorithme inférence b yésienne utilisant une variante du Monte-Carlo Hamiltonien. On peut aussi faire de l’inférence fréquentiste par optimisation.

Développement de package

Dans la continuité de ce qui a été fait à Beg-meil](https://stateofther.github.io/finistR2018/atelier3_package_creation.html), je vous propose un tour d’horizon des bonnes pratiques et de l’ensemble des outils disponibles pour réaliser le développement d’un package R.

Organisation des premières satRday française à Paris du 23 février

Séance dédiée à la préparation des satRday du lendemain: https://paris2019.satrdays.org Avec tous les bénévoles du groupe !

Efficient analysis of large-scale matrices with two R packages: bigstatsr and bigsnpr

R package {bigstatsr} provides a special class of matrix whose data is stored on the disk instead of the RAM, but you can still access the data almost as if it were in memory.

Pimp my exam

Marco et Vincent vous proposent de prendre un peu de temps pour apprendre à se servir du package exams (disponible sur le CRAN) pour générer automatiquement des examens (QCM ou autres), corriger automatiquement ces examens, gérer un ensemble d’exercices collectivement, mettre en place une plateforme de e-learning.

Modeling in the Tidyverse and applications to metagenomics data

Antoine, notre fanatique du tidyverse, nous propose de jeter un coup d’oeil à broom et rsample, des packages de tidymodels, pour travailler proprement (aka en format tibble) avec les sorties S3 des méthodes statistiques comme lm ou kmeans et faciliter l’utilisation des méthodes de rééchantillonage.