workshop

A gentle introduction to the Variational Neural Networks

Sophie Donnet and Julie Aubert propose us an introductory workshop on variational autoencoders using the keras R package under RStudio. The slides are downloadable here and the tutorial here for the complete html version and here for the only R command.

Découvrir git

Eric Adjakossa et Tâm Le Minh ont animé un atelier pratique de découverte de git : Apprendre à utiliser Git pour profiter des nombreux avantages qu’il offre, y compris l’organisation efficace d’un travail collaboratif.

Practical session - Introduction to Bayesian deep learning in Python

Charles Ollion et Sylvain Le Corff (CMAP) nous ont proposé une session pratique autour de l’apprentissage profond bayésien. Summary Deep learning is widely used for regression and classification problems, but the simplest architectures do not capture model uncertainty.

keops

Ghislain Durif a animé un premier atelier pratique autour des problèmes de l’optimisation et de leur résolution (résumé ci-dessous) le 12 février 2020. Les instructions pour installer les différents packages pour les tutoriels sont disponibles ici.

optimizer

Ghislain Durif a animé un premier atelier pratique autour des problèmes de l’optimisation et de leur résolution (résumé ci-dessous) le 22 janvier. Les instructions pour installer les différents packages pour les tutoriels sont disponibles [ici] (https://github.

Gérer des citations bib(La)tex dans un RMarkdown

Source principale : (https://rmarkdown.rstudio.com/authoring_bibliographies_and_citations.html) Lister ses références A l’aide d’un fichier de bibliographie Pandoc peut générer automatiquement des citations et une bibliographie dans différents styles. Il suffit de préciser le nom du fichier de bibligraphie en utilisant le champs bibliography dans le YAML des métadonnées du document .

Livecoding

Confinement oblige, ce vendredi 17 avril 2020 a lieu le premier State of the R en distanciel. Antoine nous a proposé une séance de live coding consacrée à la création de package sous Twitch, une plateforme de diffusion de vidéos en flux continu, qui permet de partager en temps réel l’écran et la petite bouille d’Antoine.

La plateforme Migale

Mahendra nous offre un tour sur la plateforme Migale et plus généralement sur la soumission de job sur un serveur de calcul via qsub et les packages purrr, future and furrr.

Tidyverse suite (et fin??) avec forcats, lubridate et stringr

Antoine nous parlera de la manipulation des objets un peu particuliers de R que sont les facteurs, les dates et les heures, et les chaines de caractères et expressions régulières. Ceci finira notre tour du tidyverse avec forcats, lubridate et stringr, qui permettent de manipuler très facilement et lisiblement ces objets.

Développement autour du R-Markdown

Le programme de l’atelier proposé sur des développements autour de R Markdown Créer des contenus pour R Markdown et shiny – Reporting tabulaire avec le package flextable Les fonctionnalités du package Les techniques utilisées pour l’intégration avec knitr Pratiquons : Créer une méthode d’impression tabulaire avec knitr et flextable pour les documents R Markdown – htmlwidgets : package ggiraph Les fonctionnalités du package Intégration dans le contexte shiny et dans le contexte R Markdown Implémentation du htmlwidget Pratiquons : Créer un simple htmlwidget Personnalisation des documents R Markdown Le triptyque CSS/JavaScript/HTML Exemples de thèmes xaringan, pagedown, blogdown Pratiquons : personnalisation d’un thème pagedown et d’un thème xaringan (https://github.